8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_104377
Cell Name :  jekely_1308413
Archive Name :  Jekely
Species Name :  Clam worm
Strain :  wild type
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 days
Max Age :  3.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  peripheral nervous system
Secondary Brain Region :  segment 1
Tertiary Brain Region :  left
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  split
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Catmaid.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Osmium tetraoxide
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  0.05  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Catmaid
Date of Deposition :  2018-10-25
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  jekely_1308413.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Neural circuitry of a polycystin-mediated hydrodynamic startle response for predator avoidance.

Measurements
Soma Surface :  49.37 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  44
Number of Branches :  90
Overall Width :  5.87 μm
Overall Height :  76.37 μm
Overall Depth :  16.22 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  332.7 μm
Total Surface :  261.3 μm2
Total Volume :  16.33 μm3
Max Euclidean Distance :  71.73 μm
Max Path Distance :  193.91 μm
Max Branch Order :  35
Average Contraction :  0.72
Total Fragmentation :  1259
Partition Asymmetry :  0.84
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  81.61°
Average Bifurcation Angle Remote :  89.22°
Fractal Dimension :  1.4

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