8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_104373
Cell Name :  jekely_1307524
Archive Name :  Jekely
Species Name :  Clam worm
Strain :  wild type
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 days
Max Age :  3.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  peripheral nervous system
Secondary Brain Region :  ventral nerve cord
Tertiary Brain Region :  Ipsilateral, segment 2, right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Motoneuron
Tertiary Cell Class :  bow
Original Format :  Catmaid.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Osmium tetraoxide
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  0.05  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Catmaid
Date of Deposition :  2018-10-25
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  jekely_1307524.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Neural circuitry of a polycystin-mediated hydrodynamic startle response for predator avoidance.

Measurements
Soma Surface :  53.3 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  88
Number of Branches :  178
Overall Width :  39.3 μm
Overall Height :  117.01 μm
Overall Depth :  46.93 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  772.67 μm
Total Surface :  606.85 μm2
Total Volume :  37.93 μm3
Max Euclidean Distance :  77.42 μm
Max Path Distance :  276.33 μm
Max Branch Order :  25
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  3322
Partition Asymmetry :  0.73
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  101.21°
Average Bifurcation Angle Remote :  97.42°
Fractal Dimension :  1.18

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website