8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_151832
Cell Name :  j140509a-cell-5
Archive Name :  Tolias_Jiang
Species Name :  mouse
Strain :  C57B6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  21.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  8 grams
Max Weight :  11 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Multiple
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Excitatory
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-04-12
Date of Upload :  2021-04-25
Persistence Vector :  j140509a-cell-5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Cell type composition and circuit organization of clonally related excitatory neurons in the juvenile mouse neocortex.

Measurements
Soma Surface :  2191.68 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  82
Number of Branches :  174
Overall Width :  245.05 μm
Overall Height :  1002.93 μm
Overall Depth :  106.19 μm
Average Diameter :  1.2 μm
Total Length :  12587.1 μm
Total Surface :  48426.1 μm2
Total Volume :  19182.4 μm3
Max Euclidean Distance :  884.69 μm
Max Path Distance :  1356.77 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.7
Total Fragmentation :  7189
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  1.41
Average Bifurcation Angle Local :  95.15°
Average Bifurcation Angle Remote :  53.98°
Fractal Dimension :  1.1

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website