8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_151845
Cell Name :  j140509a-cell-4
Archive Name :  Tolias_Jiang
Species Name :  mouse
Strain :  C57B6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  21.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  8 grams
Max Weight :  11 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Multiple
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Excitatory
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-04-12
Date of Upload :  2021-04-25
Persistence Vector :  j140509a-cell-4.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Cell type composition and circuit organization of clonally related excitatory neurons in the juvenile mouse neocortex.

Measurements
Soma Surface :  3197.93 μm2
Number of Stems :  15
Number of Bifurcations :  53
Number of Branches :  121
Overall Width :  242.23 μm
Overall Height :  1004.43 μm
Overall Depth :  98.44 μm
Average Diameter :  1.22 μm
Total Length :  9973.15 μm
Total Surface :  38488.4 μm2
Total Volume :  17198.7 μm3
Max Euclidean Distance :  854.19 μm
Max Path Distance :  1261.72 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.7
Total Fragmentation :  5870
Partition Asymmetry :  0.59
Average Rall's Ratio :  1.37
Average Bifurcation Angle Local :  84.75°
Average Bifurcation Angle Remote :  58.25°
Fractal Dimension :  1.1

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