8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_75649
Cell Name :  j130508-01_PC1
Archive Name :  Hajos
Species Name :  mouse
Strain :  transgenic
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  24.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  amygdala
Secondary Brain Region :  basolateral amygdala complex
Tertiary Brain Region :  basal nucleus, anterior
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Excitatory
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-04-20
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  j130508-01_PC1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Perisomatic GABAergic synapses of basket cells effectively control principal neuron activity in amygdala networks.

Measurements
Soma Surface :  1330.73 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  34
Number of Branches :  76
Overall Width :  202.49 μm
Overall Height :  254.95 μm
Overall Depth :  84.08 μm
Average Diameter :  0.45 μm
Total Length :  4255.03 μm
Total Surface :  6204.04 μm2
Total Volume :  809.57 μm3
Max Euclidean Distance :  207.73 μm
Max Path Distance :  260.45 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  1159
Partition Asymmetry :  0.46
Average Rall's Ratio :  1.6
Average Bifurcation Angle Local :  69.09°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.2°
Fractal Dimension :  1.03

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