8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_93351
Cell Name :  iter_0_66
Archive Name :  Kornfeld
Species Name :  zebra finch
Strain :  Not reported
Structural Domains :  No Dendrites, No Soma, Axon
Physical Integrity :  Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  90.0 days
Max Age :  90.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  pallium
Secondary Brain Region :  cortex
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Inhibitory
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Knossos.xml
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Osmium tetraoxide
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  0.029  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2017-04-28
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  iter_0_66.pvec

Reference Articles
Primary Article Reference :  EM connectomics reveals axonal target variation in a sequence-generating network.
Secondary Article Reference :  Automated synaptic connectivity inference for volume electron microscopy.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  6
Overall Width :  1.35 μm
Overall Height :  6.18 μm
Overall Depth :  1.13 μm
Average Diameter :  0.5 μm
Total Length :  11.71 μm
Total Surface :  18.39 μm2
Total Volume :  2.3 μm3
Max Euclidean Distance :  6.18 μm
Max Path Distance :  9.49 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  42
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  110.53°
Average Bifurcation Angle Remote :  90.32°
Fractal Dimension :  1.07

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