8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_107848
Cell Name :  hippo-539-3
Archive Name :  Lein
Species Name :  mouse
Strain :  C57Bl/6J + SVCJ129
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  25.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  dorsal
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-10-31
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  hippo-539-3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Genetic mutations in Ca(2+) signaling alter dendrite morphology and social approach in juvenile mice.

Measurements
Soma Surface :  1589.08 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  31
Overall Width :  94.09 μm
Overall Height :  107.79 μm
Overall Depth :  55.13 μm
Average Diameter :  0.4 μm
Total Length :  772.78 μm
Total Surface :  971.11 μm2
Total Volume :  97.11 μm3
Max Euclidean Distance :  86.18 μm
Max Path Distance :  108.54 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  102
Partition Asymmetry :  0.69
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  86.27°
Average Bifurcation Angle Remote :  77.29°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website