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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_95189
Cell Name :  farsight2022
Archive Name :  Roysam
Species Name :  rat
Strain :  Not reported
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  motor
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Farsight.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Farsight
Date of Deposition :  2014-11-06
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  farsight2022.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Population-scale three-dimensional reconstruction and quantitative profiling of microglia arbors.

Measurements
Soma Surface :  187.35 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  1
Number of Branches :  5
Overall Width :  18.24 μm
Overall Height :  11.96 μm
Overall Depth :  9.55 μm
Average Diameter :  1.23 μm
Total Length :  62.66 μm
Total Surface :  244.92 μm2
Total Volume :  78.59 μm3
Max Euclidean Distance :  18.1 μm
Max Path Distance :  19.46 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  113
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  1.64
Average Bifurcation Angle Local :  62.76°
Average Bifurcation Angle Remote :  51.27°
Fractal Dimension :  1.04

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