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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_95079
Cell Name :  farsight1912
Archive Name :  Roysam
Species Name :  rat
Strain :  Not reported
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  motor
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Farsight.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Farsight
Date of Deposition :  2014-11-06
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  farsight1912.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Population-scale three-dimensional reconstruction and quantitative profiling of microglia arbors.

Measurements
Soma Surface :  121.73 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  31
Overall Width :  59.24 μm
Overall Height :  33.18 μm
Overall Depth :  12.38 μm
Average Diameter :  1.21 μm
Total Length :  270.72 μm
Total Surface :  1034.74 μm2
Total Volume :  318.85 μm3
Max Euclidean Distance :  41.55 μm
Max Path Distance :  53.82 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  564
Partition Asymmetry :  0.72
Average Rall's Ratio :  1.92
Average Bifurcation Angle Local :  93.33°
Average Bifurcation Angle Remote :  99.74°
Fractal Dimension :  1.03

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