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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_94897
Cell Name :  farsight1733
Archive Name :  Roysam
Species Name :  rat
Strain :  Not reported
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  motor
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Farsight.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Farsight
Date of Deposition :  2014-11-06
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  farsight1733.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Population-scale three-dimensional reconstruction and quantitative profiling of microglia arbors.

Measurements
Soma Surface :  333.21 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  8
Overall Width :  30.68 μm
Overall Height :  16.43 μm
Overall Depth :  10.01 μm
Average Diameter :  1.21 μm
Total Length :  86.79 μm
Total Surface :  329.6 μm2
Total Volume :  100.22 μm3
Max Euclidean Distance :  38.76 μm
Max Path Distance :  42.13 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  169
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  2.01
Average Bifurcation Angle Local :  80.19°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.08°
Fractal Dimension :  1.02

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