8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_94853
Cell Name :  farsight1693
Archive Name :  Roysam
Species Name :  rat
Strain :  Not reported
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  motor
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Farsight.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Farsight
Date of Deposition :  2014-11-06
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  farsight1693.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Population-scale three-dimensional reconstruction and quantitative profiling of microglia arbors.

Measurements
Soma Surface :  188.27 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  28
Overall Width :  13.9 μm
Overall Height :  66.34 μm
Overall Depth :  31.93 μm
Average Diameter :  1.23 μm
Total Length :  308.53 μm
Total Surface :  1195.7 μm2
Total Volume :  373.04 μm3
Max Euclidean Distance :  40.22 μm
Max Path Distance :  51.03 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  670
Partition Asymmetry :  0.34
Average Rall's Ratio :  1.89
Average Bifurcation Angle Local :  92.94°
Average Bifurcation Angle Remote :  85.21°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website