8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_79907
Cell Name :  dfx-ICH-3d-4-20x-3-Iba1-6
Archive Name :  Wang_J
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  20 grams
Max Weight :  28 grams
Development :  young
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  striatum
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Deferoxamine (DFX)
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  20  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-09-05
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  dfx-ICH-3d-4-20x-3-Iba1-6.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Neuroprotection of brain-permeable iron chelator VK-28 against intracerebral hemorrhage in mice.

Measurements
Soma Surface :  465.24 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  37
Number of Branches :  80
Overall Width :  23.1 μm
Overall Height :  37.07 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.09 μm
Total Length :  223.37 μm
Total Surface :  63.16 μm2
Total Volume :  1.42 μm3
Max Euclidean Distance :  27.32 μm
Max Path Distance :  32.61 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  254
Partition Asymmetry :  0.77
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  75.08°
Average Bifurcation Angle Remote :  91.46°
Fractal Dimension :  1.09

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website