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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_192466
Cell Name :  deep_CSB096_PFC_b
Archive Name :  MacAskill
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  25 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  ventral, pyramidal layer, deep
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  prefrontal cortex (PFC)-projecting
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Alexa Fluor 594
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2022-06-17
Date of Upload :  2022-07-07
Persistence Vector :  deep_CSB096_PFC_b.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Two opposing hippocampus to prefrontal cortex pathways for the control of approach and avoidance behaviour.

Measurements
Soma Surface :  117.67 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  37
Number of Branches :  81
Overall Width :  201.7 μm
Overall Height :  585.62 μm
Overall Depth :  134.55 μm
Average Diameter :  1.37 μm
Total Length :  4494.95 μm
Total Surface :  19206.9 μm2
Total Volume :  7006.43 μm3
Max Euclidean Distance :  528.01 μm
Max Path Distance :  591.17 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  847
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  1.65
Average Bifurcation Angle Local :  79.11°
Average Bifurcation Angle Remote :  66.4°
Fractal Dimension :  1.04

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