8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_60999
Cell Name :  dSPN-SNI-A2S1N1
Archive Name :  Ren
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6-(BAC)-transgenic mouse
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  ventral striatum
Tertiary Brain Region :  nucleus accumbens, medial, shell
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  GABAergic, direct pathway
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Spared nerve injury
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2016-01-07
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  dSPN-SNI-A2S1N1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The indirect pathway of the nucleus accumbens shell amplifies neuropathic pain.

Measurements
Soma Surface :  176.86 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  16
Number of Branches :  37
Overall Width :  166.25 μm
Overall Height :  239.33 μm
Overall Depth :  36.77 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  1821.52 μm
Total Surface :  5722.48 μm2
Total Volume :  1430.62 μm3
Max Euclidean Distance :  160.62 μm
Max Path Distance :  182.22 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  784
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  74.12°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.53°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website