8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_170941
Cell Name :  d080408a-100
Archive Name :  Bathellier_Larkum
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Incomplete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  25.0 days
Max Age :  35.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  olfactory cortex
Secondary Brain Region :  piriform
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-10-12
Date of Upload :  2021-12-16
Persistence Vector :  d080408a-100.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Properties of piriform cortex pyramidal cell dendrites: implications for olfactory circuit design.

Measurements
Soma Surface :  2293.43 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  43
Number of Branches :  92
Overall Width :  420.28 μm
Overall Height :  995.66 μm
Overall Depth :  88.13 μm
Average Diameter :  0.91 μm
Total Length :  10387.7 μm
Total Surface :  32923.1 μm2
Total Volume :  12126.2 μm3
Max Euclidean Distance :  664.31 μm
Max Path Distance :  706.24 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  11168
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  1.13
Average Bifurcation Angle Local :  73.06°
Average Bifurcation Angle Remote :  42.71°
Fractal Dimension :  1.06

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