8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_170945
Cell Name :  d080328a-100
Archive Name :  Bathellier_Larkum
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  25.0 days
Max Age :  35.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  olfactory cortex
Secondary Brain Region :  piriform
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-10-12
Date of Upload :  2021-12-16
Persistence Vector :  d080328a-100.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Properties of piriform cortex pyramidal cell dendrites: implications for olfactory circuit design.

Measurements
Soma Surface :  1344.98 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  30
Number of Branches :  68
Overall Width :  498.01 μm
Overall Height :  1039.09 μm
Overall Depth :  84.24 μm
Average Diameter :  1.12 μm
Total Length :  8128.21 μm
Total Surface :  30601.2 μm2
Total Volume :  10977.9 μm3
Max Euclidean Distance :  678.91 μm
Max Path Distance :  757.43 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  7863
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  1.13
Average Bifurcation Angle Local :  89.54°
Average Bifurcation Angle Remote :  43.87°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website