8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_170951
Cell Name :  d080305a-100
Archive Name :  Bathellier_Larkum
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Incomplete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  25.0 days
Max Age :  35.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  olfactory cortex
Secondary Brain Region :  piriform
Tertiary Brain Region :  layer 2a
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  semilunar cell
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-10-12
Date of Upload :  2021-12-16
Persistence Vector :  d080305a-100.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Properties of piriform cortex pyramidal cell dendrites: implications for olfactory circuit design.

Measurements
Soma Surface :  898.93 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  16
Number of Branches :  36
Overall Width :  391.97 μm
Overall Height :  521.19 μm
Overall Depth :  65.32 μm
Average Diameter :  0.69 μm
Total Length :  3659.66 μm
Total Surface :  8277.48 μm2
Total Volume :  2195.8 μm3
Max Euclidean Distance :  441.17 μm
Max Path Distance :  495.62 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  3639
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  0.95
Average Bifurcation Angle Local :  75.33°
Average Bifurcation Angle Remote :  41.35°
Fractal Dimension :  1.04

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