8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_65019
Cell Name :  ctrl1-3
Archive Name :  Gauron
Species Name :  zebrafish
Strain :  pou4f3:GAL4 X UAS:GAP-GFP
Structural Domains :  No Dendrites, No Soma, Axon
Physical Integrity :  Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 days
Max Age :  3.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  Retinotectal
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  1  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2016-01-12
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  ctrl1-3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Hydrogen peroxide (H2O2) controls axon pathfinding during zebrafish development.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  25
Overall Width :  17.82 μm
Overall Height :  72.84 μm
Overall Depth :  45.51 μm
Average Diameter :  0.37 μm
Total Length :  169.55 μm
Total Surface :  196.02 μm2
Total Volume :  18.03 μm3
Max Euclidean Distance :  94.48 μm
Max Path Distance :  119 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  68
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  67.84°
Average Bifurcation Angle Remote :  63.43°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website