8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108807
Cell Name :  crop0_2_seg_split_42_0-95
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.8 months
Max Age :  3.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  28 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  crop0_2_seg_split_42_0-95.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  58.11 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  1
Number of Branches :  6
Overall Width :  15.95 μm
Overall Height :  40.3 μm
Overall Depth :  9.86 μm
Average Diameter :  0.17 μm
Total Length :  123.48 μm
Total Surface :  70.09 μm2
Total Volume :  3.7 μm3
Max Euclidean Distance :  29.04 μm
Max Path Distance :  47.83 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.7
Total Fragmentation :  442
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  0.68
Average Bifurcation Angle Local :  68.75°
Average Bifurcation Angle Remote :  48.99°
Fractal Dimension :  1.15

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