8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108791
Cell Name :  crop0_2_seg_split_25_1-35
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.8 months
Max Age :  3.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  28 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  crop0_2_seg_split_25_1-35.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  58.18 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  19
Number of Branches :  43
Overall Width :  14.54 μm
Overall Height :  27.99 μm
Overall Depth :  15.73 μm
Average Diameter :  0.18 μm
Total Length :  287.23 μm
Total Surface :  188.26 μm2
Total Volume :  18.71 μm3
Max Euclidean Distance :  33.22 μm
Max Path Distance :  49.59 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  779
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  1.94
Average Bifurcation Angle Local :  84.27°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.04°
Fractal Dimension :  1.15

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