8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108804
Cell Name :  crop0_2_seg_split_23_1-3
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.8 months
Max Age :  3.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  28 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  crop0_2_seg_split_23_1-3.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  58.2 μm2
Number of Stems :  11
Number of Bifurcations :  71
Number of Branches :  153
Overall Width :  43.77 μm
Overall Height :  40.46 μm
Overall Depth :  30.42 μm
Average Diameter :  0.2 μm
Total Length :  1206.39 μm
Total Surface :  825.43 μm2
Total Volume :  68.66 μm3
Max Euclidean Distance :  36.86 μm
Max Path Distance :  95.12 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.79
Total Fragmentation :  3115
Partition Asymmetry :  0.65
Average Rall's Ratio :  3.15
Average Bifurcation Angle Local :  79.53°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.29°
Fractal Dimension :  1.15

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