8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108801
Cell Name :  crop0_2_seg_split_22_1
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.8 months
Max Age :  3.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  28 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  crop0_2_seg_split_22_1.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  58.12 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  24
Number of Branches :  55
Overall Width :  33.57 μm
Overall Height :  39.57 μm
Overall Depth :  26.18 μm
Average Diameter :  0.22 μm
Total Length :  457.02 μm
Total Surface :  356.33 μm2
Total Volume :  29.71 μm3
Max Euclidean Distance :  30.55 μm
Max Path Distance :  50.65 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  1323
Partition Asymmetry :  0.44
Average Rall's Ratio :  1.24
Average Bifurcation Angle Local :  67.02°
Average Bifurcation Angle Remote :  53.43°
Fractal Dimension :  1.12

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