8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108820
Cell Name :  crop0_2_seg_split_20_1-7
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.8 months
Max Age :  3.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  28 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  crop0_2_seg_split_20_1-7.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  58.03 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  54
Number of Branches :  115
Overall Width :  36.53 μm
Overall Height :  41.76 μm
Overall Depth :  25.43 μm
Average Diameter :  0.2 μm
Total Length :  777.32 μm
Total Surface :  547.16 μm2
Total Volume :  39.81 μm3
Max Euclidean Distance :  40.55 μm
Max Path Distance :  90.4 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  2027
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  1.49
Average Bifurcation Angle Local :  88.59°
Average Bifurcation Angle Remote :  85.56°
Fractal Dimension :  1.18

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