8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108799
Cell Name :  crop0_2_seg_split_12_1-35
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.8 months
Max Age :  3.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  28 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  crop0_2_seg_split_12_1-35.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  58.22 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  48
Number of Branches :  101
Overall Width :  30.39 μm
Overall Height :  49.21 μm
Overall Depth :  27.24 μm
Average Diameter :  0.2 μm
Total Length :  747.72 μm
Total Surface :  530.12 μm2
Total Volume :  74.33 μm3
Max Euclidean Distance :  34.84 μm
Max Path Distance :  55.37 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.79
Total Fragmentation :  2246
Partition Asymmetry :  0.43
Average Rall's Ratio :  1.57
Average Bifurcation Angle Local :  74.47°
Average Bifurcation Angle Remote :  77.25°
Fractal Dimension :  1.17

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