8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108805
Cell Name :  crop0_1_seg_split_1_0-95
Archive Name :  Dong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.8 months
Max Age :  3.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  28 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2019-04-04
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  crop0_1_seg_split_1_0-95.pvec
Note :  Processed with G-Cut

Reference Article
Related Article Reference :  Precise segmentation of densely interweaving neuron clusters using G-Cut.

Measurements
Soma Surface :  58.19 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  16
Number of Branches :  39
Overall Width :  31.65 μm
Overall Height :  50.58 μm
Overall Depth :  16.57 μm
Average Diameter :  0.18 μm
Total Length :  347.02 μm
Total Surface :  220.99 μm2
Total Volume :  15.62 μm3
Max Euclidean Distance :  45.92 μm
Max Path Distance :  72.66 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.79
Total Fragmentation :  1222
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  5.95
Average Bifurcation Angle Local :  83.86°
Average Bifurcation Angle Remote :  72.96°
Fractal Dimension :  1.16

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