8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108225
Cell Name :  cortex401-2
Archive Name :  Lein
Species Name :  mouse
Strain :  T4826I-RYR1
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  25.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-10-31
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  cortex401-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Genetic mutations in Ca(2+) signaling alter dendrite morphology and social approach in juvenile mice.

Measurements
Soma Surface :  792.05 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  14
Overall Width :  52.45 μm
Overall Height :  74.4 μm
Overall Depth :  28.79 μm
Average Diameter :  0.4 μm
Total Length :  345.56 μm
Total Surface :  434.24 μm2
Total Volume :  43.42 μm3
Max Euclidean Distance :  55.99 μm
Max Path Distance :  66.9 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  46
Partition Asymmetry :  0.2
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  59.19°
Average Bifurcation Angle Remote :  57.65°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website