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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_108194
Cell Name :  cortex-560-6
Archive Name :  Lein
Species Name :  mouse
Strain :  C57Bl/6J + SVCJ129
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  25.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-10-31
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  cortex-560-6.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Genetic mutations in Ca(2+) signaling alter dendrite morphology and social approach in juvenile mice.

Measurements
Soma Surface :  1027.23 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  4
Number of Branches :  12
Overall Width :  70.29 μm
Overall Height :  97.91 μm
Overall Depth :  22.7 μm
Average Diameter :  0.4 μm
Total Length :  350.05 μm
Total Surface :  439.88 μm2
Total Volume :  43.99 μm3
Max Euclidean Distance :  71.61 μm
Max Path Distance :  130.74 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  36
Partition Asymmetry :  0.25
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  92.4°
Average Bifurcation Angle Remote :  85.97°
Fractal Dimension :  1.04

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