8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_08787
Cell Name :  control-20-wt
Archive Name :  Beguin
Species Name :  mouse
Strain :  Arx(GCG)7-1 KI (B6)
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  15.0 days
Max Age :  17.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2012-06-27
Date of Upload :  2013-01-15
Persistence Vector :  control-20-wt.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  An Epilepsy-Related ARX Polyalanine Expansion Modifies Glutamatergic Neurons Excitability and Morphology Without Affecting GABAergic Neurons Development.

Measurements
Soma Surface :  250.36 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  33
Number of Branches :  73
Overall Width :  206.72 μm
Overall Height :  210.66 μm
Overall Depth :  63.5 μm
Average Diameter :  0.11 μm
Total Length :  2682.23 μm
Total Surface :  1083.39 μm2
Total Volume :  47.79 μm3
Max Euclidean Distance :  188.94 μm
Max Path Distance :  294.76 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  808
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  2.27
Average Bifurcation Angle Local :  63.24°
Average Bifurcation Angle Remote :  50.28°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website