8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_157887
Cell Name :  cell_4
Archive Name :  Opitz
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 days
Max Age :  5.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  10 grams
Max Weight :  10 grams
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Biocytin, streptavidin-488
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-05-17
Date of Upload :  2021-07-01
Persistence Vector :  cell_4.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Multi-scale Modeling Toolbox for Single Neuron and Subcellular Activity under (repetitive) Transcranial Magnetic Stimulation

Measurements
Soma Surface :  303.59 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  42
Number of Branches :  90
Overall Width :  283.99 μm
Overall Height :  725.08 μm
Overall Depth :  130.11 μm
Average Diameter :  0.66 μm
Total Length :  6644.45 μm
Total Surface :  13504 μm2
Total Volume :  3309.84 μm3
Max Euclidean Distance :  457.6 μm
Max Path Distance :  754.99 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.79
Total Fragmentation :  7554
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  1.66
Average Bifurcation Angle Local :  87.72°
Average Bifurcation Angle Remote :  72.69°
Fractal Dimension :  1.08

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website