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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_06157
Cell Name :  cell1-7-CA1
Archive Name :  Pozzo-Miller
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  10.0 days
Max Age :  10.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  yellow fluorescent protein
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2010-03-01
Date of Upload :  2011-03-10
Persistence Vector :  cell1-7-CA1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Dendritic spine pathologies in hippocampal pyramidal neurons from Rett syndrome brain and after expression of Rett-associated MECP2 mutations.

Measurements
Soma Surface :  1258.57 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  60
Number of Branches :  123
Overall Width :  251.28 μm
Overall Height :  506.85 μm
Overall Depth :  4.5 μm
Average Diameter :  0.5 μm
Total Length :  5124.57 μm
Total Surface :  8049.66 μm2
Total Volume :  1006.21 μm3
Max Euclidean Distance :  474.64 μm
Max Path Distance :  553 μm
Max Branch Order :  25
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  512
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  72.55°
Average Bifurcation Angle Remote :  59.34°
Fractal Dimension :  1.01

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