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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_06147
Cell Name :  cell1-2a-CA1
Archive Name :  Pozzo-Miller
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  10.0 days
Max Age :  10.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  yellow fluorescent protein
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2010-03-01
Date of Upload :  2011-03-10
Persistence Vector :  cell1-2a-CA1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Dendritic spine pathologies in hippocampal pyramidal neurons from Rett syndrome brain and after expression of Rett-associated MECP2 mutations.

Measurements
Soma Surface :  1933.14 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  47
Number of Branches :  99
Overall Width :  234.03 μm
Overall Height :  688.82 μm
Overall Depth :  15.5 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  7608.3 μm
Total Surface :  23902.2 μm2
Total Volume :  5975.54 μm3
Max Euclidean Distance :  462.92 μm
Max Path Distance :  537.25 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  545
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  61.5°
Average Bifurcation Angle Remote :  43.05°
Fractal Dimension :  1.02

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