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Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_118089
Cell Name :  cell011
Archive Name :  Abdolhoseini_Kluge
Species Name :  mouse
Strain :  CX3CR1gpf/+
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.5 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  Central nervous system
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Not reported
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  30  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2019-08-19
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  cell011.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Segmentation, Tracing, and Quantification of Microglial Cells from 3D Image Stacks.

Measurements
Soma Surface :  152.4 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  10
Number of Branches :  28
Overall Width :  37.28 μm
Overall Height :  24.35 μm
Overall Depth :  6 μm
Average Diameter :  1.04 μm
Total Length :  166.88 μm
Total Surface :  537.64 μm2
Total Volume :  145.03 μm3
Max Euclidean Distance :  23.39 μm
Max Path Distance :  45.12 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  107
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  2.04
Average Bifurcation Angle Local :  90.63°
Average Bifurcation Angle Remote :  94.58°
Fractal Dimension :  1.04

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