8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_111989
Cell Name :  cell-pair-20111014sc2b
Archive Name :  Topolnik
Species Name :  mouse
Strain :  Vip-eGFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  15.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  15 grams
Max Weight :  20 grams
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  oriens/alveus border
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  Vasoactive Intestinal Peptide (VIP)-positive, subiculum-projecting
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-04-17
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  cell-pair-20111014sc2b.pvec
Note :  Soma surface should be used for quantitative analysis

Reference Article
Related Article Reference :  Connectivity and network state-dependent recruitment of long-range VIP-GABAergic neurons in the mouse hippocampus.

Measurements
Soma Surface :  3496.54 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  90
Number of Branches :  184
Overall Width :  234.38 μm
Overall Height :  1257.43 μm
Overall Depth :  84 μm
Average Diameter :  1.13 μm
Total Length :  12137.9 μm
Total Surface :  43404.7 μm2
Total Volume :  12545.3 μm3
Max Euclidean Distance :  872.96 μm
Max Path Distance :  1137.62 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  3340
Partition Asymmetry :  0.61
Average Rall's Ratio :  1.98
Average Bifurcation Angle Local :  83.17°
Average Bifurcation Angle Remote :  82.96°
Fractal Dimension :  1.04

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