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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_05312
Cell Name :  cell-2-trace
Archive Name :  Chalupa
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  ganglion layer
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  Monostratified
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2009-06-29
Date of Upload :  2009-09-04
Persistence Vector :  cell-2-trace.pvec
Note :  dendrites in layers 1 and 5

Reference Article
Related Article Reference :  Morphological properties of mouse retinal ganglion cells.

Measurements
Soma Surface :  359.31 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  32
Number of Branches :  71
Overall Width :  285.71 μm
Overall Height :  416.85 μm
Overall Depth :  11.89 μm
Average Diameter :  0.64 μm
Total Length :  5240.91 μm
Total Surface :  11147.5 μm2
Total Volume :  2295.38 μm3
Max Euclidean Distance :  326.75 μm
Max Path Distance :  348.72 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  3935
Partition Asymmetry :  0.35
Average Rall's Ratio :  1.75
Average Bifurcation Angle Local :  82.36°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.76°
Fractal Dimension :  1.03

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