8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_05379
Cell Name :  cell-116-trace
Archive Name :  Chalupa
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  ganglion layer
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  bistratified
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  lucifer yellow
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2009-06-29
Date of Upload :  2009-09-04
Persistence Vector :  cell-116-trace.pvec
Note :  dendrites in layers 2 and 4

Reference Article
Related Article Reference :  Morphological properties of mouse retinal ganglion cells.

Measurements
Soma Surface :  149.66 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  96
Number of Branches :  194
Overall Width :  178.5 μm
Overall Height :  236.07 μm
Overall Depth :  18.55 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  5628.18 μm
Total Surface :  17887 μm2
Total Volume :  4664.27 μm3
Max Euclidean Distance :  185.67 μm
Max Path Distance :  272.27 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  3416
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  2.01
Average Bifurcation Angle Local :  86.35°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.66°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website