8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_134885
Cell Name :  cell-10-Biocytin_25X_-ims
Archive Name :  Naegele
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6NHsd
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  granule layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  adult-born
Original Format :  Imaris.hoc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Status epilepticus
Staining Method :  mCherry, enhanced yellow fluorescent protein, biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  25x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-04-15
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  cell-10-Biocytin_25X_-ims.pvec
Note :  1 week post status epilepticus (SE), non-innervated

Reference Article
Related Article Reference :  Restrained Dendritic Growth of Adult-Born Granule Cells Innervated by Transplanted Fetal GABAergic Interneurons in Mice with Temporal Lobe Epilepsy.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  15
Number of Branches :  32
Overall Width :  141.57 μm
Overall Height :  199.71 μm
Overall Depth :  80.42 μm
Average Diameter :  1.75 μm
Total Length :  1948.73 μm
Total Surface :  10564.9 μm2
Total Volume :  5769.86 μm3
Max Euclidean Distance :  147.72 μm
Max Path Distance :  268.15 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  2748
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  1.97
Average Bifurcation Angle Local :  66.28°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.99°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website