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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_60496
Cell Name :  cKO_PFC_5
Archive Name :  Qiu
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  35.0 days
Max Age :  40.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  conditional Knock-Out
Staining Method :  Golgi
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2016-01-17
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  cKO_PFC_5.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The autism-associated MET receptor tyrosine kinase engages early neuronal growth mechanism and controls glutamatergic circuits development in the forebrain.

Measurements
Soma Surface :  1183.47 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  18
Number of Branches :  43
Overall Width :  115.34 μm
Overall Height :  287.8 μm
Overall Depth :  65.85 μm
Average Diameter :  1.26 μm
Total Length :  1996.81 μm
Total Surface :  8132.62 μm2
Total Volume :  3032.86 μm3
Max Euclidean Distance :  217.73 μm
Max Path Distance :  267.31 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  474
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.67
Average Bifurcation Angle Local :  62.74°
Average Bifurcation Angle Remote :  48.75°
Fractal Dimension :  1.03

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