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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_64018
Cell Name :  br_2654
Archive Name :  Denk
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  30.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  bipolar
Tertiary Cell Class :  rod
Original Format :  Knossos.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium and lead citrate
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  0.025  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 14%
Corrected (no values given)
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2015-01-10
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  br_2654.pvec
Note :  Converted to SWC by jefferislab.org/si/nblast

Reference Article
Related Article Reference :  Connectomic reconstruction of the inner plexiform layer in the mouse retina.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  52
Number of Branches :  106
Overall Width :  10.29 μm
Overall Height :  82.29 μm
Overall Depth :  11.95 μm
Average Diameter :  1.96 μm
Total Length :  331.71 μm
Total Surface :  2026.05 μm2
Total Volume :  991.21 μm3
Max Euclidean Distance :  76.76 μm
Max Path Distance :  102.27 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  1129
Partition Asymmetry :  0.43
Average Rall's Ratio :  1.99
Average Bifurcation Angle Local :  115.29°
Average Bifurcation Angle Remote :  84.45°
Fractal Dimension :  1.12

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