8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_05705
Cell Name :  bg0121e
Archive Name :  Jaeger
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  16.0 days
Max Age :  21.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  globus pallidus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2009-08-25
Date of Upload :  2010-11-05
Persistence Vector :  bg0121e.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Channel density distributions explain spiking variability in the globus pallidus: a combined physiology and computer simulation database approach.

Measurements
Soma Surface :  832.4 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  18
Overall Width :  258.17 μm
Overall Height :  544.61 μm
Overall Depth :  127.68 μm
Average Diameter :  0.73 μm
Total Length :  1733.46 μm
Total Surface :  3903.48 μm2
Total Volume :  890.04 μm3
Max Euclidean Distance :  381.99 μm
Max Path Distance :  554.28 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  616
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  1.65
Average Bifurcation Angle Local :  81.06°
Average Bifurcation Angle Remote :  60.97°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website