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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_63949
Cell Name :  bc_3709
Archive Name :  Denk
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  30.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  bipolar
Tertiary Cell Class :  cone
Original Format :  Knossos.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium and lead citrate
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  0.025  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 14%
Corrected (no values given)
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2015-01-10
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  bc_3709.pvec
Note :  Converted to SWC by jefferislab.org/si/nblast

Reference Article
Related Article Reference :  Connectomic reconstruction of the inner plexiform layer in the mouse retina.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  67
Number of Branches :  136
Overall Width :  10.97 μm
Overall Height :  54.04 μm
Overall Depth :  17.49 μm
Average Diameter :  1.5 μm
Total Length :  381.12 μm
Total Surface :  1795.97 μm2
Total Volume :  673.49 μm3
Max Euclidean Distance :  44.94 μm
Max Path Distance :  68.74 μm
Max Branch Order :  15
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  1322
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  109.39°
Average Bifurcation Angle Remote :  92.92°
Fractal Dimension :  1.11

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