8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_63671
Cell Name :  bc_1986
Archive Name :  Denk
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  30.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  bipolar
Tertiary Cell Class :  cone
Original Format :  Knossos.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  osmium and lead citrate
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  0.025  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 14%
Corrected (no values given)
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Knossos
Date of Deposition :  2015-01-10
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  bc_1986.pvec
Note :  Converted to SWC by jefferislab.org/si/nblast

Reference Article
Related Article Reference :  Connectomic reconstruction of the inner plexiform layer in the mouse retina.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  113
Number of Branches :  228
Overall Width :  15.71 μm
Overall Height :  66.6 μm
Overall Depth :  11.97 μm
Average Diameter :  1.62 μm
Total Length :  406.16 μm
Total Surface :  2025.78 μm2
Total Volume :  815.57 μm3
Max Euclidean Distance :  56.19 μm
Max Path Distance :  87.18 μm
Max Branch Order :  22
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  1147
Partition Asymmetry :  0.63
Average Rall's Ratio :  1.98
Average Bifurcation Angle Local :  103.41°
Average Bifurcation Angle Remote :  99.64°
Fractal Dimension :  1.14

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