8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_165465
Cell Name :  ak1_crop1_4_1
Archive Name :  BICCN-MOp-miniatlas-anatomy
Species Name :  mouse
Strain :  Etv1-CreERT2; MORF3
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  58.0 days
Max Age :  58.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  21.4 grams
Max Weight :  21.4 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2020-04-03
Date of Upload :  2021-10-06
Persistence Vector :  ak1_crop1_4_1.pvec
Note :  This reconstruction was obtained from the Yang and Dong labs

Reference Article
Related Article Reference :  Cellular Anatomy of the Mouse Primary Motor Cortex

Measurements
Soma Surface :  38.56 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  29
Number of Branches :  68
Overall Width :  276.39 μm
Overall Height :  385.93 μm
Overall Depth :  214.17 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  6640.46 μm
Total Surface :  5215.41 μm2
Total Volume :  325.96 μm3
Max Euclidean Distance :  249.04 μm
Max Path Distance :  285.14 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  2789
Partition Asymmetry :  0.3
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  63.64°
Average Bifurcation Angle Remote :  57.79°
Fractal Dimension :  1.03

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