8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_165611
Cell Name :  ag1_Etv1_5_01_LH_crop4
Archive Name :  BICCN-MOp-miniatlas-anatomy
Species Name :  mouse
Strain :  Etv1-CreERT2; MORF3
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  58.0 days
Max Age :  58.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  21.4 grams
Max Weight :  21.4 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2020-04-03
Date of Upload :  2021-10-06
Persistence Vector :  ag1_Etv1_5_01_LH_crop4.pvec
Note :  This reconstruction was obtained from the Yang and Dong labs

Reference Article
Related Article Reference :  Cellular Anatomy of the Mouse Primary Motor Cortex

Measurements
Soma Surface :  57.14 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  15
Number of Branches :  38
Overall Width :  201.14 μm
Overall Height :  239.68 μm
Overall Depth :  145.96 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  2946.09 μm
Total Surface :  2313.85 μm2
Total Volume :  144.62 μm3
Max Euclidean Distance :  180.6 μm
Max Path Distance :  229 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  1713
Partition Asymmetry :  0.29
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  65.15°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.5°
Fractal Dimension :  1.02

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