8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_165393
Cell Name :  ag1_5_01_rh_cell2
Archive Name :  BICCN-MOp-miniatlas-anatomy
Species Name :  mouse
Strain :  Etv1-CreERT2; MORF3
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  58.0 days
Max Age :  58.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  21.4 grams
Max Weight :  21.4 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2020-04-03
Date of Upload :  2021-10-06
Persistence Vector :  ag1_5_01_rh_cell2.pvec
Note :  This reconstruction was obtained from the Yang and Dong labs

Reference Article
Related Article Reference :  Cellular Anatomy of the Mouse Primary Motor Cortex

Measurements
Soma Surface :  75.33 μm2
Number of Stems :  13
Number of Bifurcations :  88
Number of Branches :  189
Overall Width :  2029.39 μm
Overall Height :  4565.8 μm
Overall Depth :  225.97 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  52428.8 μm
Total Surface :  164940 μm2
Total Volume :  41439.5 μm3
Max Euclidean Distance :  4099.53 μm
Max Path Distance :  4922.67 μm
Max Branch Order :  27
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  4361
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  71.65°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.74°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website