8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_165396
Cell Name :  ag1_5_01_rh_cell1
Archive Name :  BICCN-MOp-miniatlas-anatomy
Species Name :  mouse
Strain :  Etv1-CreERT2; MORF3
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  58.0 days
Max Age :  58.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  21.4 grams
Max Weight :  21.4 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2020-04-03
Date of Upload :  2021-10-06
Persistence Vector :  ag1_5_01_rh_cell1.pvec
Note :  This reconstruction was obtained from the Yang and Dong labs

Reference Article
Related Article Reference :  Cellular Anatomy of the Mouse Primary Motor Cortex

Measurements
Soma Surface :  100.3 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  51
Number of Branches :  110
Overall Width :  972.15 μm
Overall Height :  3438.09 μm
Overall Depth :  197.08 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  25576.9 μm
Total Surface :  80682.6 μm2
Total Volume :  20556 μm3
Max Euclidean Distance :  2051.45 μm
Max Path Distance :  2091.14 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  2470
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  51.54°
Average Bifurcation Angle Remote :  56.37°
Fractal Dimension :  1.01

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