8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_165481
Cell Name :  ag1_5_01_lh_crop1_1
Archive Name :  BICCN-MOp-miniatlas-anatomy
Species Name :  mouse
Strain :  Etv1-CreERT2; MORF3
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  58.0 days
Max Age :  58.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  21.4 grams
Max Weight :  21.4 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2020-04-03
Date of Upload :  2021-10-06
Persistence Vector :  ag1_5_01_lh_crop1_1.pvec
Note :  This reconstruction was obtained from the Yang and Dong labs

Reference Article
Related Article Reference :  Cellular Anatomy of the Mouse Primary Motor Cortex

Measurements
Soma Surface :  103.42 μm2
Number of Stems :  11
Number of Bifurcations :  77
Number of Branches :  165
Overall Width :  1329.96 μm
Overall Height :  4289.26 μm
Overall Depth :  259.19 μm
Average Diameter :  1.03 μm
Total Length :  42513.5 μm
Total Surface :  136660 μm2
Total Volume :  37483 μm3
Max Euclidean Distance :  3862.64 μm
Max Path Distance :  4286.99 μm
Max Branch Order :  23
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  5335
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  2.13
Average Bifurcation Angle Local :  57.02°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.9°
Fractal Dimension :  1.01

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