8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_165579
Cell Name :  ae1_6_rh_crop3
Archive Name :  BICCN-MOp-miniatlas-anatomy
Species Name :  mouse
Strain :  Cux2-CreERT2; MORF3
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  50.0 days
Max Age :  50.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  18.7 grams
Max Weight :  18.7 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  projection
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2020-04-03
Date of Upload :  2021-10-06
Persistence Vector :  ae1_6_rh_crop3.pvec
Note :  This reconstruction was obtained from the Yang and Dong labs

Reference Article
Related Article Reference :  Cellular Anatomy of the Mouse Primary Motor Cortex

Measurements
Soma Surface :  4.22 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  28
Number of Branches :  63
Overall Width :  153.44 μm
Overall Height :  205.2 μm
Overall Depth :  143.33 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  3172.75 μm
Total Surface :  2491.87 μm2
Total Volume :  155.74 μm3
Max Euclidean Distance :  146.92 μm
Max Path Distance :  185.77 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  1838
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  83.19°
Average Bifurcation Angle Remote :  53.71°
Fractal Dimension :  1.03

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