8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_165366
Cell Name :  ae1_6_01_rh_crop2
Archive Name :  BICCN-MOp-miniatlas-anatomy
Species Name :  mouse
Strain :  Cux2-CreERT2; MORF3
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  50.0 days
Max Age :  50.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  18.7 grams
Max Weight :  18.7 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  projection
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2020-04-03
Date of Upload :  2021-10-06
Persistence Vector :  ae1_6_01_rh_crop2.pvec
Note :  This reconstruction was obtained from the Yang and Dong labs

Reference Article
Related Article Reference :  Cellular Anatomy of the Mouse Primary Motor Cortex

Measurements
Soma Surface :  81.32 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  18
Number of Branches :  41
Overall Width :  879.35 μm
Overall Height :  954.53 μm
Overall Depth :  184.92 μm
Average Diameter :  1.14 μm
Total Length :  9421.82 μm
Total Surface :  32292.4 μm2
Total Volume :  11066.9 μm3
Max Euclidean Distance :  617.2 μm
Max Path Distance :  811.28 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  1265
Partition Asymmetry :  0.34
Average Rall's Ratio :  3.35
Average Bifurcation Angle Local :  60.3°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.22°
Fractal Dimension :  1.02

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