8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_165471
Cell Name :  ae1_6_01_rh_crop1_5
Archive Name :  BICCN-MOp-miniatlas-anatomy
Species Name :  mouse
Strain :  Cux2-CreERT2; MORF3
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  50.0 days
Max Age :  50.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  18.7 grams
Max Weight :  18.7 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2020-04-03
Date of Upload :  2021-10-06
Persistence Vector :  ae1_6_01_rh_crop1_5.pvec
Note :  This reconstruction was obtained from the Yang and Dong labs

Reference Article
Related Article Reference :  Cellular Anatomy of the Mouse Primary Motor Cortex

Measurements
Soma Surface :  131.75 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  47
Number of Branches :  100
Overall Width :  1599.69 μm
Overall Height :  972.85 μm
Overall Depth :  154.57 μm
Average Diameter :  1.25 μm
Total Length :  18887.7 μm
Total Surface :  73203 μm2
Total Volume :  34246.4 μm3
Max Euclidean Distance :  1956.09 μm
Max Path Distance :  2002.3 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  2450
Partition Asymmetry :  0.36
Average Rall's Ratio :  3.17
Average Bifurcation Angle Local :  67.26°
Average Bifurcation Angle Remote :  66.44°
Fractal Dimension :  1.01

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