8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_165506
Cell Name :  ae1_6_01_rh_crop1_4
Archive Name :  BICCN-MOp-miniatlas-anatomy
Species Name :  mouse
Strain :  Cux2-CreERT2; MORF3
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  50.0 days
Max Age :  50.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  18.7 grams
Max Weight :  18.7 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Aivia.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  500  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  30x
Reconstruction Method :  Aivia
Date of Deposition :  2020-04-03
Date of Upload :  2021-10-06
Persistence Vector :  ae1_6_01_rh_crop1_4.pvec
Note :  This reconstruction was obtained from the Yang and Dong labs

Reference Article
Related Article Reference :  Cellular Anatomy of the Mouse Primary Motor Cortex

Measurements
Soma Surface :  97.12 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  44
Number of Branches :  92
Overall Width :  993.29 μm
Overall Height :  2274.59 μm
Overall Depth :  215.29 μm
Average Diameter :  1.09 μm
Total Length :  17290.5 μm
Total Surface :  58487.2 μm2
Total Volume :  19345.5 μm3
Max Euclidean Distance :  2189.69 μm
Max Path Distance :  2246.52 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  2398
Partition Asymmetry :  0.44
Average Rall's Ratio :  2.56
Average Bifurcation Angle Local :  64.63°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.24°
Fractal Dimension :  1.01

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